Wanneer men tot de ontdekking komt welke behandelingsmogelijkheden er bestaan voor deze conditie - met name hormonale en operatieve behandeling - is het gevolg dan ook vrijwel steeds dat men onmiddellijk tot deze behandeling wil overgaan. Door dit vooruitzicht vermindert het innerlijk conflict, maar het is pas nu dat het maatschappelijk conflict tenvolle zal losbarsten. Meteen gaat zich ook een bijzondere medische en juridische problematiek stellen. Het totaal van stappen dat moet gezet worden om tot een geslachtsaanpassing of geslachtsbevestiging (geniet bij velen de voorkeur boven de term "geslachtsverandering") te komen wordt algemeen het transitieproces genoemd. Hoe dit proces er dient uit te zien werd vastgelegd in de 'Standards of care', en omvat een aantal specifieke fases; zo is er eerst een fase van diagnostiek, daarna hormonale behandeling en real-life experience, en als laatste operatieve behandeling. Daarnaast vormen epilatie , stemveranderingen en esthetische operaties vaak even belangrijke behandelingen om de transitie tot een succes te maken.

Een infobrochure over het behandelprotocol van het genderteam van het UZ Gent kun je in een worddocument downloaden (opgelet, dit bestand is 5 MB groot!!!)